El Modelo Dirigido por el Usuario es el que representa más cercanamente el arreglo actual de la Iniciativa Misional bajo el Plan de Trabajo conjunto del NPS-INAH para el 2003-2006. Los programas misionales son uno de las cuatro áreas claves dirigidas por el plan actual. Como facilitador del plan de trabajo, IMRICO ha establecido la conservación, investigación, educación y promoción como áreas de prioridad alrededor del se fomentará la colaboración. Según este arreglo, la Iniciativa Misional sería dirigida por los representantes del NPS e INAH. Las partes interesadas y los socios serían identificados de acuerdo a su potencial para contribuir a los programas de NPS/INAH en cada una de las cuatro áreas principales.
Este arreglo no requeriría ninguna reestructura organizacional significante bajo el plan de trabajo actual. Las relaciones entre las agencias primarias de conservación de los recursos culturales en los Estados Unidos y México son claramente definidos, lo que asegura la estabilidad de los acuerdos binacionales. Para los propósitos de colaboración, el Modelo Dirigido por el Usuario promueve la cooperación flexible e inter-disciplinario entre todos los socios. Esta estructura mantiene una relación estrictamente jerárquica de agencias federales sobre otras posibles partes intersadas.